AlphaFold - deepmind.com/research/case-…, alphafold.ebi.ac.uk
Просто невозможно пройти мимо. Нейросеть для предсказания фолдинга белков.
О чем речь - в наших клетках организма (почти) все функции выполняют сложные наномашины - белкИ. Но мы не знаем, как многие из них выглядят, а те что знаем - знаем плохо. Хотя в теории, последовательность аминокислот (букв) белка почти полностью определяет его 3D-структуру.
Алгоритмы предсказания структуры по последовательности работают только для простых белков. Прогресс измеряет бенчмарк CASP, который регулярно берёт новейшие, не опубликованные, экспериментально полученные структуры, и оценивает алгоритмы. AplhaFold сделал хороший скачок в AUC.
AlphaFold, как мне кажется, немного перехайплен. Но в целом, область предсказания структуры белков и других биомолекул (и близкая к ней "молекулярная динамика", предсказывающая движение этих молекул) - это несомненно крутая и очень сложная область биоинформатики, за ней будущее.
Посмотрите на эту красоту!
![notion image](https://www.notion.so/image/https%3A%2F%2Fpbs.twimg.com%2Fmedia%2FE-8OvuqX0AMF7Id.png?table=block&id=ecea936f-f21f-4693-9ecb-9658a0073c53&cache=v2)
![Дима Борисевич](https://www.notion.so/image/https%3A%2F%2Fi.imgur.com%2FC83SdUm.jpeg?table=block&id=cad718eb-4c00-4eab-b264-ec74abf45cca&cache=v2)