Полная вычислительная модель живого организма
cell.com/fulltext/S0092…
Целая модель 28 клеточных процессов одного простейшего организма.
Очень хочется, чтобы живые организмы, или хотя бы какие-то процессы в них, можно было симулировать на компьютере. Эту область называют "системной биологией". Обычно симулируют дрожжи - они простые, и важны для биотех бизнеса.
Можно также симулировать химическую кинетику (т.е. как протекают хим. реакции) отдельных процессов в клетках человека, очень ограничено. А как насчёт симуляции целого, пусть и простого организма? Существуют попытки симулировать всю хим. кинетику дрожжей S.Cerevisiae.
Но мне приглянулась статья про бактерию микоплазму. В ней авторы собрали 900+ публикаций, описывающих отдельные параметры отдельных процессов, и сделали цельную модель, симулирующую кучу процессов разом.
Причем, отдельные процессы могут описываться совершенно разными моделями - дифференциальными уравнениями, вероятностными моделями, или другими узкоспециальными. Все их авторы смогли собрать вместе, что по-моему абсолютно адский труд и невероятное достижение.
Авторы утверждают, что их модель буквально предсказывает поведение процессов в клетке микоплазмы, которое воспроизводится экспериментально. То есть буквально, удаётся симулировать бактерию исходя из "первых принципов", что почти никогда не происходит в биологии.
С одной стороны - это всего одна, простейшая, бактериальная клетка, и это несерьезно. С другой - это огромный результат. Я очень надеюсь дожить до того момента, когда мы такую же модель соберём для всего человека.
Дима Борисевич